Para submissão de projetos de pesquisa, o NAPE instituiu além do preenchimento do formulário com informações pertinentes ao projeto, o envio de algumas documentações obrigatórias. Para que as análises operacionais e científicas possam ser realizadas adequadamente, o proponente deverá anexar no próprio formulário de submissão os seguintes documentos; arquivo equivalente ao termo de consentimento ou solicitação de dispensa de consentimento, o projeto de pesquisa detalhado, orçamento com fonte absorvedora de custos declarada e a carta de anuência assinada pela diretoria da instituição em que se realizará a pesquisa.
O NAPE desenvolveu modelos de todas estas documentações para auxiliar os proponentes, caso seja necessário providenciar algum documento obrigatório que a equipe do projeto não possua.