Sequenciamento molecular de nova geração e análise do perfil de metilação de DNA permitem caracterizar tumores cerebrais raros.

Um estudo desenvolvido por pesquisadores do Instituto D’Or de Pesquisa e Ensino (IDOR) e da Anatomia Patológica Rede D’Or em conjunto com diversas instituições norte-americanas, incluindo o National Cancer Institute (NIH), utilizou novas análises moleculares para desvendar os mecanismos biológicos de tumores cerebrais pediátricos e o refinamento da sua classificação. Os resultados da pesquisa foram divulgados recentemente na revista Acta Neuropathologica Communications.

Os tumores embrionários do sistema nervoso central (SNC) são uma classe de tumores malignos compostos por células neuroepiteliais embrionárias, predominantemente encontrados em crianças. Atualizações recentes na classificação da Organização Mundial da Saúde (OMS) incluiu vários novos subtipos desses tumores, evidenciando a importância crescente dos estudos epigenéticos na definição dessas subcategorias. Os estudos epigenéticos, particularmente o perfil de metilação de DNA tem uma importância crescente na classificação dos tumores cerebrais e delineação de novos tipos de tumor. A aplicação dessa técnica permitiu a identificação de um grupo particular de casos, em que a análise genética revelou uma alteração molecular específica (fusão envolvendo os genes BRD4 e LEUTX).

O gene BRD4 (Bromodomain Containing 4) atua na regulação transcricional e no desenvolvimento, além de manter a pluripotência das células-tronco e sua desregulação tem sido associada a diferentes tipos de câncer, pois contribui para a proliferação celular e progressão tumoral. Por outro lado, o gene LEUTX (Leucina Vinte Homeobox), tem papel no desenvolvimento embrionário e na regulação da diferenciação celular precoce.

Neste estudo, a análise minuciosa de quatro casos novos com estas alterações moleculares e cinco outros casos descritos isoladamente na literatura revelou características clínicas, radiológicas e histopatológicas semelhantes, indicando tratar-se de muito provavelmente de um tipo específico de tumor. Todos os pacientes eram crianças com até 4 anos, com tumores volumosos, de crescimento rápido e comportamento clínico agressivo. Entretanto, alguns casos responderam bem à quimioterapia.

Embora o tamanho da amostra seja pequeno, os resultados preliminares indicaram que esses tumores são clinicamente agressivos, exigindo estratégias de tratamento personalizadas que combinou quimioterapia à remoção cirúrgica total do tumor. Vale destacar que inibidores de BRD4 de pequenas moléculas e degradadores de BRD4 mostraram resultados promissores em estudos preliminares em malignidades hematológicas e sólidas, e podem representar uma futura via terapêutica para esses tumores agressivos do SNC. 

Laboratório de Anatomia Patológica Rede D’Or / IDOR

O laboratório da Anatomia Patológica possui estrutura para análises celulares e moleculares de última geração, com equipamentos distribuídos nos laboratórios do IDOR no Rio, Salvador e São Paulo, com destaque para Microscopia Confocal, Sequenciamento de Nova Geração Genexus, Sequenciamento de Nova Geração Illumina NovaSeq 6000), Scanner de Microarrays – Illumina iScan e RNA Digital – Biologia Espacial (Nanostring).

Além disso, responde pela gestão do Biobanco IDOR / Rede D’Or, que recebe, armazena e faz a gestão de amostras de tumor, lâminas de tumor, DNA e RNA de diferentes origens, células tumorais, amostras de líquor (LCR), sangue e plasma, de células mononucleares periféricas (PBMC) e de vesículas extracelulares, que permitirá acelerar a pesquisa clínica, PD&I de biomarcadores, pesquisas de novos alvos terapêuticos e favorecer o desenvolvimento de terapias avançadas, com redução de custos.

Principais áreas de pesquisa do Laboratório de Patologia Molecular IDOR/Rede D’Or:
• Painéis moleculares para detecção de variantes de material genético dos tumores (DNA e RNA);
• Painéis para biópsia líquida para identificar material genético de tumores na circulação;
• Painéis de metilação para reconhecimento de alterações epigenéticas no câncer;
• Análises por biologia espacial, que combinam a análise morfológica do tecido tumoral ao perfil molecular do câncer para caracterização das diferentes populações celulares que formam o tumor;
• Análise de transcriptoma e RNAseq.

Escrito por Manuelly Gomes
Revisado por Claudio Ferrari